El tercer título consecutivo de la Bundesliga lo consiguió en 2001, en la última jornada del campeonato. El domingo terminó la octava fecha del campeonato de la Liga Profesional y ya este martes arranca la novena con cinco partidos de interés diverso. Jornada muy novedosa, camiseta imitación lewandowski de jueves a sábado: 29-30 y 31 de diciembre (Nochevieja sólo hasta el horario de las 16.15 horas partidos de corta distancia para que el que no juegue de local llegue a casa a cenar). En las últimas horas trascendió mediante una publicación vía Twitter de Alfonso Guzmán, uno de los delegados del ente, que algunos de los jugadores que obtuvieron visa tipo B1 para ir disputar juegos amistosos de pretemporada, habrían decidido no regresar al país. Ese año en cambio se perdió la final de la Copa de Europa contra el Aston Villa por 0:1. Por otra parte, entre 1966 y 1981 el Bayern colocó a varios de sus jugadores en el galardón del futbolista del año en Alemania hasta un total de once veces: Beckenbauer (4), Maier (3), Müller (2), Rummenigge y Breitner con uno.
A lo largo de la historia, son varios los jugadores que han jugado en ambos equipos, algunos de los cuales, pasaron inadvertidos para la afición rival, mientras que otros fueron el objetivo de la dura rivalidad de las respectivas aficiones. El gráfico que a continuación se expone indica cómo evolucionará el tiempo a lo largo de la semana en Córdoba. En la primera temporada de Hitzfeld, el Bayern conquistó la Bundesliga y estuvo cerca de conquistar la Liga de Campeones, pero perdieron 1:2 contra el Manchester United en el tiempo extra después de estar ganando en la mayor parte del partido. En el partido más crucial de la temporada contra el Benfica por su importancia deportiva, social y económica, el técnico de Terrassa confió antes en Gavi, Nico González, un lateral derecho (Sergiño Dest) y un Ousmane Dembélé al 50% que en Coutinho. El equipo notó sus ausencias durante tres años en los que no consiguió ningún título.
La temporada de 1975-76 no fue buena durante el mando de Cramer, debido a que antes del parón invernal ocuparía la décima posición en liga. Además, durante la temporada le endosaron un 11:1 al Borussia Dortmund. En la temporada 1996-97 Trapattoni regresó como entrenador volviendo a conquistar el campeonato, pero en la siguiente temporada el Bayern no consiguió el título -el campeón fue el Kaiserlautern-, y Trapattoni tuvo que despedirse. ↑ Transvaal fue declarado campeón ya que Deportivo Saprissa se retiró antes de la final. La Supercopa de Europa la disputarían ante el Magdeburgo, quien venía de vencer en la final de la Recopa de Europa al Milan, pero el Bayern y el Magdeburgo no pudieron ponerse de acuerdo en la fecha del partido, y terminó por no jugarse. Bayern vencería en las rondas finales al Magdeburgo con global 5:3, Ararat Ereván con global 2:1, Saint-Étienne con global 2:0, y al Leeds United.
En la temporada de 1999-00 el Bayern ganó su tercer doblete. Beckenbauer regresó brevemente al final de la temporada de 1995-96 como entrenador adjunto y condujo al equipo hacia la victoria en la Copa de la UEFA 1995-96, venciendo al Girondins de Burdeos en la final. Después de un segundo lugar en 1990-91, el club solo obtuvo cinco puntos más que los clubes descendidos en 1991-92. En la temporada de 1992-93, el Bayern perdió en la Copa de la UEFA en la segunda ronda contra el Norwich City -único club inglés que le ha derrotado en su antiguo estadio, el estadio Olímpico de Múnich-. Estás despedido». El nuevo entrenador sería Dettmar Cramer, el cual no lograría salvar la temporada en la Bundesliga, pero conseguiría defender el título como campeones de Europa. El éxito regresó cuando Franz Beckenbauer asumió el control en la segunda mitad de la temporada de 1993-94, ganando la Bundesliga nuevamente después de una brecha de cuatro años.
XIX, pero que alcanzan grandes cotas de éxito en la segunda mitad del s. 79, 80 u 81 equipos de 54 de las 55 federaciones miembro de la UEFA participan en la Liga de Campeones 2020-21 (a excepción de Liechtenstein y Suiza, que organizan una liga doméstica conjunta). Copa de Campeones de Europa. También perderían ambos juegos ante el Dinamo de Kiev en la Supercopa de Europa. En el entretiempo de la ida, el Dinamo ganaba por 3:2 en Múnich, pero el Bayern daría vuelta al marcador para ganar 4:3. Dresde tenía una buena posición de cara al partido de vuelta, sin embargo, el Bayern ya estaba delante del marcador 2:0 tras doce minutos con dos goles de Uli Hoeneß. Posteriormente vino el duelo alemán ante el Dinamo Dresde. Posteriormente vencerían al Malmö y al Benfica, para disputar la semifinal ante el Real Madrid.
La final en Bruselas sería contra el Atlético de Madrid. El partido se iría a prórroga tras empatar a cero, donde Luis Aragonés le daría el 1:0 al Atlético tras un tiro libre. Dos hechos que refuerzan su posición en plena guerra con el presidente del Real Madrid e impulsor de la Superliga, Florentino Pérez, y el presidente de la Federación Española de Fútbol, Luis Rubiales. El equipo siguió en dudas con la derrota en casa a manos del Club San Luis por 1-0, el empate con las Chivas por 0-0 y una sufrida victoria sobre el Puebla por 2-1, camiseta bayern múnich lewandowski dándose el inicio de la polémica decisión de Carrillo de darle pocos minutos de juego a los refuerzos Martín Romagnoli y Emanuel Villa. Poco después del descanso, Dresde alcanzaría el empate a los 52′ y cuatro minutos después se irían arriba 3:2. Gerd Müller anotaría el empate a los 58′. El Bayern no tendría problemas en llegar a la final tras dejar en el camino al CSKA Sofía en cuartos, y al Újpest Dózsa en semifinales.